Principal component analysis - Practice 1.1

Abstract

This brief guide is intended to familiarize the reader with the following:

Loading and installing R packages. Loading data sets of different formats from R base installation and from local directories. Basic descriptive statistics. Graphical utils from ggplot2 package. Deal with outliers: identification and making decisions. Principal component analysis: requirements, obtaining principal components, explained variance, appropriate number of principal components, graphical outputs, coordenates in the new reference system.

Esta breve guía tiene como objetivo familiarizar al lector con lo siguiente:

Carga e instalación de paquetes R. Carga de conjuntos de datos de diferentes formatos desde la instalación base de R y desde directorios locales. Estadística descriptiva básica. Utilidades gráficas del paquete ggplot2. Tratar con valores atípicos: identificación y toma de decisiones. Análisis de componentes principales: requisitos, obtención de componentes principales, varianza explicada, número adecuado de componentes principales, salidas gráficas, coordenadas en el nuevo sistema de referencia.