Genómica y transcriptómica de los cromosomas B del saltamontes Eyprepocnemis plorans
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Afficher la notice complèteAuteur
Martín Peciña, MaríaEditorial
Universidad de Granada
Director
Martínez Camacho, Juan PedroDepartamento
Universidad de Granada. Programa de Doctorado en Biología Fundamental y de SistemasMateria
Genómica Genomics Transcriptómica Cromosoma B Saltamontes Eyprepocnemis plorans Grasshoppers
Date
2021Fecha lectura
2021-03-05Referencia bibliográfica
Martín Peciña, María. Genómica y transcriptómica de los cromosomas B del saltamontes Eyprepocnemis plorans. Granada: Universidad de Granada, 2021. [http://hdl.handle.net/10481/67821]
Patrocinador
Tesis Univ. Granada.; Ministerio de Economía y Competitividad a través del proyecto CGL2015-70750-P.; FPU del Ministerio de Educación, Cultura y Deporte: FPU13/01553.; Ayudas para la Movilidad Internacional de Estudiantes de Doctorado Universidad de Granada y CI-BIOTIC (2015/2016).Résumé
A lo largo de esta tesis doctoral desciframos gran parte del contenido molecular de
los cromosomas B de E. plorans valiéndonos de herramientas bioinformáticas,
moleculares y citogenéticas que nos han permitido abordar un reto que permanecía
inalcanzable. Además, con estas herramientas también contribuimos a clarificar las
diferencias entre el ADN satélite y las repeticiones en tándem a partir del análisis del
satelitoma de E. plorans, que constituye parte de una nueva base de datos de ADN
repetitivo para esta especie. Apoyados en esta base genómica, desvelamos que los
cromosomas B contienen decenas de genes codificantes de proteínas que además
presentan una expresión activa, especialmente en ovario. Sin embargo, en los individuos
con cromosomas B no sólo se expresan los genes que éstos contienen, también se
produce una respuesta contundente por parte del genoma hospedador, probablemente
encaminada a gestionar el conflicto intragenómico provocado por estos elementos
egoístas. De hecho, los resultados que presentamos en esta tesis dibujan un escenario en
el que los cromosomas B se eliminan en los machos de E. plorans pero se acumulan en
las hembras, lo que podría tener su espejo molecular en la alta expresión de copias de
genes del B y la infraexpresión de algunos genes de los As que observamos sobre todo en
ovario, retratando las bases moleculares de un verdadero conflicto intragenómico. Throughout this doctoral thesis we have deciphered much of the molecular content
of B chromosomes in E. plorans, using bioinformatic, molecular and cytogenetic tools,
which have allowed us to address a challenge that remained unattainable. In addition,
using these tools we have also contributed to clarify the differences between satellite
DNA and tandem repeats after the characterization of the E. plorans satellitome, which
also constitutes part of a de novo repetitive DNA database in this species. Based on this
genomic approach, we have revealed that B chromosomes contain dozens of proteincoding
genes that show active transcription, especially in ovary. However, in B-carrying
individuals, not only the B-located genes are expressed, as there is also a forceful response from the host genome, presumably addressed to manage the intragenomic
conflict caused by these selfish elements. In fact, the results included here draw a
scenario comprising B chromosome elimination in males but accumulation though
females of E. plorans, which could have its molecular mirror on the high expression of Bgenes
and the under-expression of some genes in the host genome that we observe in
ovary. These results constitute the first window opened to unveil the molecular details of
this intragenomic conflict.