La 3’ UTR del RNA genómico del virus del Nilo Occidental codifica información clave para la regulación de la traducción Ramos Lorente, Sara Esther Berzal Herranz, Alfredo Romero López, Cristina Universidad de Granada. Programa de Doctorado en Bioquímica y Biología Molecular La traducción de los genomas de RNA virales depende de la maquinaria celular del hospedador, por lo que los virus emplean mecanismos que les permiten competir por ella con los mRNAs celulares. Como otros virus RNA, los flavivirus codifican parte de su información genética en elementos estructurales conservados. Estos elementos se agrupan en dominios que regulan funciones virales esenciales, como la replicación y la traducción, mediante el ajuste de la estructura global del genoma viral a través del establecimiento de interacciones inter- e intramoleculares. En flavivirus, el inicio de traducción se produce principalmente por un mecanismo dependiente de cap, aunque en varios miembros del género se ha descrito un mecanismo alternativo independiente de cap. La 3’ UTR genómica interviene en la regulación de ambos procesos, pero se desconocen los mecanismos moleculares subyacentes. En la presente Memoria de Tesis Doctoral se proporciona evidencia de que, como en otros flavivirus, la 3’ UTR del virus del Nilo Occidental (WNV) potencia la traducción viral dependiente e independiente de cap. Los resultados obtenidos apoyan que este efecto podría estar mediado por el reclutamiento específico de la subunidad ribosómica 40S a través de la 3’ UTR. Se han identificado dos sitios de reclutamiento de 40S por la 3’ UTR, en el elemento SL-III y en el dominio II, que podrían tener implicaciones funcionales diferentes. La combinación de técnicas de análisis estructural ha revelado requisitos conformacionales específicos en la 3’ UTR para que se produzca la unión de 40S, los cuales implican a los elementos conservados SL-III, 5’DB, 3’DB y 3’SL, involucrados en la regulación de la traducción viral. También se aportan evidencias de que la formación del doble pseudoknot PK3-PK4, en el que están implicados los elementos 5’ y 3’DB, es esencial para que se produzca el reclutamiento de 40S a través de cualquiera de los dos sitios identificados. Nuestro estudio, además, apunta a que el establecimiento de interacciones directas RNA–RNA a larga distancia entre los extremos del genoma viral tiene un efecto modulador de la estructura de la 3’ UTR de WNV que permite la liberación de la subunidad 40S desde la 3’ UTR al extremo 5’ del RNA viral, facilitando su posicionamiento en las proximidades del codón de inicio de la traducción. En base a estos resultados, se propone que la interacción entre los extremos 5’ y 3’ podría actuar como regulador del reclutamiento de 40S y, en último término, como regulador de la traducción en WNV. Finalmente, se aportan evidencias que sugieren que el reclutamiento de la subunidad 40S a través de la 3’ UTR es un mecanismo conservado en otros miembros del género Flavivirus. 2024-09-23T08:00:16Z 2024-09-23T08:00:16Z 2024 2024-07-05 doctoral thesis Sara Esther Ramos Lorente. La 3’ UTR del RNA genómico del virus del Nilo Occidental codifica información clave para la regulación de la traducción. Granada: Universidad de Granada, 2024. [https://hdl.handle.net/10481/94840] 9788411954327 https://hdl.handle.net/10481/94840 spa http://creativecommons.org/licenses/by-nc-nd/4.0/ open access Attribution-NonCommercial-NoDerivatives 4.0 Internacional Universidad de Granada