Impacto de la comunidad microbiana presente en bentonitas sobre los procesos biogeoquímicos del sistema ternario bentonita/microorganismo/radionucleido: implicaciones para el concepto de almacenamiento geológico profundo de residuos nucleares

Abstract

En esta tesis doctoral se desarrolló y propuso un protocolo optimizado que facilita la extracción de ADN de la bentonita. Dicho protocolo con mayores rendimientos basado en el método clásico de extracción con fenol:cloroformo en combinación con tratamientos previos de lisis mecánica y química, proporcionó suficiente ADN bacteriano (2-6 ng/μL) para realizar NGS y obtener datos válidos de la diversidad microbiana. Al ser considerado como el método más efectivo para la bentonita, en comparación con otros métodos basados en kits comerciales, este protocolo se utilizó en todos los experimentos que requerían de extracción de ADN, incluyendo la de bentonitas compactadas.

An optimized protocol that facilitates the extraction of higher DNA-yields from bentonite was developed and proposed in this PhD thesis. Based on the phenol:chloroform technique and combined with previous mechanical and chemical lyses it provided sufficient DNA (2-6 ng/μL) from Spanish bentonite to perform NGS and obtain valid microbial diversity data. Being considered as the most effective for bentonite (including the compacted one) in comparison to other commercial and kitbased methods, this house-made protocol was used for all DNA extractions from bentonite procedures in all the designed experiments.