Bases genéticas de la formación de biofilms bacterianos en superficies abióticas y vegetales

Abstract

El objetivo de esta tesis es el estudio de comunidades sésiles de Pseudomonas putida KT2440, una especie reconocida por su labor promotora del crecimiento plantar y cuya estabilización en la rizosfera constituye una barrera para posibles infecciones por organismos patógenos. Sabiendo que la forma de vida preferida de las bacterias en el medio ambiente es “asociadas a superficies solidas y rodeadas por una matriz extracelular” (Costerton et al., 1995) y mediante la implementación de nuevas técnicas en generación de biofilms, hemos realizado una serie de estudios más fieles a la realidad de los actores implicados en la adhesión, tanto a superficies bióticas como abióticas, por parte de Pseudomonas putida KT2440.

En esta tesis se abordan tres puntos fundamentales, reflejados en profundidad en cada una de las 3 publicaciones incluidas: • Analizar la presencia y distribución filogenética de grandes proteínas secretadas, con un posible papel en adhesión, entre bacterias cuyo genoma completo está disponible en las bases de datos. Se pretendía establecer si estas proteínas eran ubicuas, sus características y la similitud entre ellas. • Identificar nuevos determinantes genéticos implicados en la colonización de superficies vegetales por Pseudomonas putida KT2440, estableciendo también su posible papel en la formación de biofilms. El objetivo era completar el análisis genético de la adhesión bacteriana a semillas y raíces y establecer las similitudes y diferencias entre el establecimiento de poblaciones sésiles sobre superficies abióticas y sobre superficies vegetales. • Identificar y caracterizar mutaciones que favorecieran el establecimiento de biofilms por P. putida KT2440, con el fin de explorar posibles mecanismos reguladores de la transición de vida planctónica a vida sésil y viceversa en esta bacteria.