Impacto de la retrotransposición del elemento LINE-1 en genomas pluripotentes

Abstract

Long interspersed element 1 (LINE-1) ó L1 es el retrotransposón autónomo más eficiente encontrado en mamíferos. Constituye el 17% del ADN humano y. dada su condición proliferativa y mutagénica puede causar daños o beneficios en el ADN de la célula hospedadora ya sea por su capacidad generadora de rearreglos cromosómicos, e por efectos sutiles y específicos en los que puede afectar la expresión génica de una célula hospedera. Aunque el L1 hace parte constitutiva de la mayoría de las unidades de transcripción en los genomas mamíferos, los efectos de sus inserciones que principalmente son intronicas, aún son objeto de investigación. En general se ha observado que la retrotransposición del L1 tiende a darse en células germinales o en fases tempranas del desarrollo, datos que indican que nuestro genoma pluripotente es un sustrato natural para el proceso de retrotransposición. Por tanto es relevante la determinación del impacto causado por las nuevas inserciones del L1 en los genomas pluripotentes y su papel en el proceso de diferenciación celular. Los eventos de retrotransposición del L1, en los que impacta unidades codificantes de genomas pluripotentes, traen como consecuencias cambios en la estructura molecular del gen que pueden interferir o no en su expresión en el estado pluripotente, aunque su efecto en el proceso de diferenciación celular no se ha observado. El conocimiento de estos eventos contribuiría a la etiología y epidemiologia molecular, de las afecciones humanas causadas por inserciones del L1 llevadas a cabo en células madre en el desarrollo temprano de un individuo, además contribuiría aportando datos con respecto a las orientaciones funcionales desde el punto de vista evolutivo. El presente estudio busca determinar el impacto a nivel molecular causado por los eventos de retrotransposición del elemento L1 en secuencias codificantes de genomas pluripotentes y su repercusión en el estado diferenciado. Para esto se generaron a partir de un novedoso sistema de rescate en plásmido (Recovery) líneas celulares transgénicas pluripotentes a partir de células de carcinoma embrionario humano (hECs) PA1 con inserciones únicas del L1 dentro de unidades génicas identificadas.