Identificación in silico, caracterización molecular y análisis de expresión de la proteína de filamento para flagelar PFR3 del Tripanosoma brucei

Abstract

En el presente artículo se describen la identificación y el aislamiento del gen codificante para la proteína PFR3 del T. brucei. La secuencia deducida de aminoácidos produce una proteína de 592 residuos con un punto isoeléctrico de 5,14 y presenta una identidad de secuencia del 68,9% con la proteína PFR3 del T. cruzi. Sin embargo, el porcentaje de homología entre la proteína PFR3 de T. brucei y otras secuencias disponibles de PFRs de T. brucei y T. cruzi es inferior al 22%. En contraste con lo descrito para los miembros de la familia de proteínas de filamento paraflagelar, la mayor divergencia entre las proteínas PFR3 de T. cruzi y T. brucei se encuentra en la región central de la proteína, con una similitud del 38% en 200 aminoácidos. Estimamos que existen dos copias de la proteína PFR3 de T. brucei por genoma haploide. El gen se transcribe como mARN de aproximadamente 3,6 kb de longitud, presente con la misma abundancia en formas parasitarias procíclicas y del torrente sanguíneo.

In the present paper we describe the identification and isolation of the gene coding for T. brucei PFR3 protein. The deduced amino acid sequence produces a protein of 592 residues with an isoelectric point of 5.14 and shows a 68.9% sequence identity with T. cruzi PFR3 protein. However, the percentage of homology among T. brucei PFR3 and other available PFRs sequences from T. brucei and T. cruzi is lower than 22%. In contrast to that described for members of paraflagellar rod protein family, the highest divergence between T. cruzi and T. brucei PFR3 proteins is located at the central region of the protein with a 38% of similarity over 200 amino acid. We estimate that there exist two copies of the T. brucei PFR3 protein per haploid genome. The gene is transcribed as a mRNA of approximately 3.6 kb in length, equally abundant in both procyclic and bloodstream parasite forms.