@misc{10481/103218,
year = {2025},
url = {https://hdl.handle.net/10481/103218},
abstract = {Objetivo: Desarrollar un protocolo para la detección precoz y caracterización de cepas
bacterianas causantes de infecciones adquiridas por hospitalización en centros
hospitalarios de Centroamérica, con el fin de mejorar el tratamiento de pacientes
sometidos a intervención en la UCI.
Metodología: Se realizó un estudio observacional prospectivo con pacientes
diagnosticados con infecciones adquiridas en el hospital (IAAS). Se llevaron a cabo
pruebas de susceptibilidad a antimicrobianos y análisis moleculares de genes de
carbapenemasa en aislados de Acinetobacter baumannii en un primer período de enero
de 2017 a diciembre de 2018.
De enero a diciembre de 2021, se recolectaron aislados clínicos de Acinetobacter
calcoaceticus-baumannii complex y Klebsiella pneumoniae de muestras de esputo,
aspirados traqueales, heridas, sangre, catéteres y orina de pacientes diagnosticados con
IAAS. El perfil de susceptibilidad se determinó utilizando el sistema automatizado Vitek
2 Compact (BIOUMERIEUX), empleando los puntos de corte establecidos por el
Instituto de Estándares Clínicos y de Laboratorio (CLSI). Se realizaron secuencias de
cebadores para detectar genes de oxacilinasa mediante reacción en cadena de la
polimerasa (PCR), identificando la presencia del gen blaoxa72 y diferenciándolo del gen
blaoxa24 mediante la secuenciación de un fragmento de ADN de 246 pb. Para K.
pneumoniae, las pruebas moleculares determinaron la presencia de los genes blaKPC,
diferenciando entre blaKPC-1, blaKPC-2 y blaKPC-3.
Resultados: Se incluyeron 180 pacientes con edades entre 16 y 93 años en un estudio
realizado de enero de 2017 a diciembre de 2018. La tasa de mortalidad hospitalaria fue
del 35% (63/180). La ventilación mecánica invasiva (VMI) fue indicada en el 50,4% de
los pacientes (91/180). La tasa de supervivencia general (SG) en pacientes tratados con
VMI fue del 49,5% (45/91), con una mediana de supervivencia de 65 días. La tasa de SG en pacientes que no recibieron VMI fue del 80,9% (72/89), con una mediana de
supervivencia de 106 días (HR 2,094; IC 95% 1,174-3,737; p = 0,012). El análisis
multivariado concluyó que la neumonía asociada al ventilador es el factor más
relacionado con la supervivencia general. En un subsecuente estudio realizado de enero
a diciembre de 2021 se obtuvieron 401 aislados de A. baumannii y K. pneumoniae de
223 y 120 pacientes, respectivamente. La mediana de edad fue de 65 años. El 40,2% de
los pacientes fueron admitidos por neumonía bacteriana y el 35,9% por neumonía
relacionada con COVID-19. El 73,2% de los pacientes permaneció en UCI, y el 79,1%
requirió VMI. Después de una estancia media de 26 días (RIC 16 a 40), fallecieron 192
pacientes. El análisis multivariado reveló que para A. baumannii, los factores
independientes de letalidad fueron COVID-19 (HR 2.260; IC 95% 1.562 - 3.269;
p<.001), APACHE II (HR 1.059; IC 95% 1.022 - 1.098; p=.002), ITU (HR 1,813; IC
95% 1,077 - 3,051; p=0,025), VMI (HR 2,907; IC 95% 1,139 - 7,412; p=0,025) y
resistencia a tigeciclina (HR 2,117; IC 95%). Para K. pneumoniae, la COVID-19 fue el
único factor independiente de letalidad (HR 2,439; IC 95% 1,458 - 4,082; p=.001). Se
encontró que el gen blaoxa72 estaba presente en 65 aislados de A. baumannii, mientras
que en K. pneumoniae se hallaron genes blaKPC, con 18 aislados de blaKPC-2 y 10 de
blaKPC-3.
Conclusiones: Los resultados demostraron que el gen blaoxa72 es el principal
mecanismo de resistencia a los carbapenémicos en A. baumannii. Por otro lado, los genes
blaKPC-2 y blaKPC-3 están presentes en K. pneumoniae y son el principal mecanismo
de resistencia a los carbapenémicos en Ecuador.},
abstract = {Objective: To develop a protocol for early detection and characterization of bacterial
strains causing hospital-acquired infections in Central American hospitals, to improve
the treatment of patients undergoing ICU intervention.
Methodology: This prospective observational study included patients diagnosed with
hospital-acquired infections (HAIs). Antimicrobial susceptibility tests were performed,
followed by molecular analysis of carbapenemase genes in A. baumannii isolates. The
study was conducted in two phases: from January 2017 to December 2018 and from
January to December 2021. Clinical isolates of Acinetobacter calcoaceticus-baumannii
complex and K. pneumoniae were collected from sputum samples, tracheal aspirates,
wounds, blood, catheters, and urine of patients with HAIs. Susceptibility profiles were
determined using the Vitek 2 compact automated system (BioMérieux), with cut-off
points established by the Clinical and Laboratory Standards Institute (CLSI). Polymerase
chain reaction (PCR) was used to detect oxacillinase genes, differentiating between the
blaOXA-72 and blaOXA-24 genes by sequencing a 246 bp DNA fragment. For K.
pneumoniae, molecular tests identified the presence of the blaKPC gene, including
blaKPC-1, blaKPC-2, and blaKPC-3.
Results: A total of 180 patients (ages 16 to 93 years) were included in a study conducted
from January 2017 to December 2018. The in-hospital mortality rate was 35% (63/180).
Invasive mechanical ventilation (IMV) was used in 50.4% of patients (91/180), with an
overall survival rate of 49.5% (45/91) and a median survival of 65 days. Patients not
receiving IMV had an overall survival rate of 80.9% (72/89) and a median survival of
106 days (HR 2.094; 95% CI 1.174-3.737; p = 0.012). Multivariate analysis indicated
that ventilator-associated pneumonia was most significantly related to overall survival. A total of 401 isolates were analyzed, from 223 patients with A. baumannii and 120 with
K. pneumoniae included in a study conducted from January to December 2021. The
median age was 65 years. Of these patients, 40.2% were admitted for bacterial
pneumonia and 35.9% for COVID-19-related pneumonia. The majority (73.2%) were in
the ICU, and 79.1% required IMV. After a mean ICU stay of 26 days (IQR 16 to 40),
192 patients died. Multivariate analysis confirmed that COVID-19 (HR 2.260; 95% CI
1.562-3.269; p < 0.001), APACHE II score (HR 1.059; 95% CI 1.022-1.098; p = 0.002),
urinary tract infection (UTI) (HR 1.813; 95% CI 1.077-3.051; p = 0.025), IMV (HR
2.907; 95% CI 1.139-7.412; p = 0.025), and resistance to tigecycline (HR 2.117; 95%
CI 1.138-3.922; p = 0.016) were associated with mortality. In K. pneumoniae, COVID-
19 was the only independent factor significantly associated with lethality (HR 2.439;
95% CI 1.458-4.082; p = 0.001). The blaOXA-72 gene was detected in 65 A. baumannii
isolates, while blaKPC was found in K. pneumoniae, with 18 isolates containing
blaKPC-2 and 10 containing blaKPC-3.
Conclusions: The study found that blaOXA-72 is the primary mechanism of carbapenem
resistance in A. baumannii, whereas blaKPC-2 and blaKPC-3 are the main mechanisms
of carbapenem resistance in K. pneumoniae in Ecuador.},
organization = {Tesis Univ. Granada.},
publisher = {Universidad de Granada},
keywords = {Resistencia antimicrobiaana},
keywords = {Carbapenemasas},
keywords = {Oxacilinasas},
keywords = {Antimicrobial resistance},
keywords = {Carbapenemases},
keywords = {Oxacillinases},
title = {Resistencia a Antimicrobianos de Acinetobacter Baumannii y Klebsiella Pneumoniae: Incidencia, Gasto Sanitario, Muertes o Problemas Derivados en Ecuador},
doi = {9788411957588},
author = {Abarca Coloma, Luz},
}