Las herramientas de análisis filogenético para el estudio de la propagación de la epidemia de VIH-1 en Andalucía oriental

Abstract

Desde comienzos de los años 1982 la epidemia de VIH en España ha seguido una dinámica cambiante en la distribución de subtipos, prevalencia de las rutas de transmisión y en las características de los colectivos de riesgo de transmisión del virus. El análisis filogenético, a través del análisis de las relaciones filogenéticas entre las diferentes formas genéticas que infectan a los pacientes de una determinada región, aporta información valiosa sobre la existencia de ciertos colectivos de riesgo y ayuda a inferir una relación evolutiva que nos permita establecer un marco temporal de la historia evolutiva del virus. Dentro del análisis filogenético, los análisis filogeográficos a través del estudio de las relaciones epidemiológicas entre los eventos migratorios y la diseminación del VIH a nivel local, son herramientas especialmente importantes en escenarios donde existe una alta tasa de migración ya que ésta puede influir en la epidemiología local. Asimismo, la filodinámica aporta información acerca del tamaño efectivo poblacional de una determinada forma genética permitiendo analizar el crecimiento o decrecimiento del número efectivo de infecciones a lo largo del tiempo.

En los últimos años están apareciendo diferentes estudios en diferentes cohortes de pacientes naïve, que utilizan el análisis filogenético como herramienta para estudiar el comportamiento de la epidemia de VIH en una determinada área: Yebra et al demuestran en la comunidad de Madrid una mayor inclusión de homosexuales en cluster de transmisión y Ambrosioni et al concluyen que desde el periodo de 2008 a 2010 el 42% de los pacientes naïve de la cohorte suiza se agruparon en cluster de transmisión. Pernas et al describen un aumento de la prevalencia del subtipo F en Galicia debido a la existencia de un cluster de transmisión que se transmite en el norte de España y Delgado et al han identificado un cluster de transmisión de subtipo A entre pacientes homosexuales en diversas áreas de España, advirtiendo de la necesidad de una vigilancia epidemiológica continua. Recientemente, Patiño et al han alertado de la emergencia de la variante de VIH CRF19_cpx entre homosexuales, una variante endémica de Cuba, relacionada con una mayor progresión de los pacientes a SIDA y asociada a mutaciones de resistencia a fármacos antirretrovirales de primera línea.